Soruşturma kapsamında hazırlanan iddianamede, hastane çalışanlarının bebeklerin ölümüne yönelik ürkütücü konuşmaları yer aldı. İddianameye göre, şüphelilerden biri olan Hasan Basri G., bir hemşireye "Mehtap çocuğu öldür, 50 satürasyonlu çocuk mu olur" şeklinde talimat verdiği belirtildi. Hemşire Mehtap S. ise bu talimata, "Öldüreceğim de öldürsem de bir dert biliyorsun yani" şeklinde karşılık verdiği iddia edildi.
47 şüphelinin yer aldığı iddianamede, başhekime 266 yıl hapis cezası istendi. Soruşturmada, bebeklerin anlaşmalı başka hastanelere sevk edilmesi için yapılan telefon görüşmelerine de ulaşıldı. Bu durum, bebeklerin özel hastanelerde gereksiz yere yoğun bakıma alındığını ve maddi çıkar sağlamak amacıyla ihmal edildiğini gösteriyor.
Savcıyı tehdit eden çete üyeleri tutuklandı. Soruşturmayı yürüten savcı daha önce çete üyeleri tarafından tehdit edilmişti. Bu olayın ardından başlatılan soruşturma ile çetenin üyeleri yakalanarak adliyeye sevk edildi.
İddianame kabul edilirse yargılama başlayacak. Bakırköy 22. Ağır Ceza Mahkemesi'nde görülecek olan davada, şüphelilerin bebeklerin ölümüne nasıl sebep oldukları ve bu suç örgütünde kimlerin yer aldığı ortaya çıkacak.
Kamuoyunda büyük yankı uyandıran bu olay, sağlık sistemindeki denetimlerin yetersizliğini bir kez daha gözler önüne serdi. Bebeklerin yaşam haklarının bu şekilde hiçe sayılması, toplumda büyük bir infiale neden oldu.